پژوهشکده مهرستان (مطالعات حکمرانی)، یک پژوهشکده تقاضامحور و خودگردان است که با همکاری مشترک دانشگاه اصفهان و مرکز احیاء اندیشه و سیره علوی راه اندازی شده است و به منظور تلاش فعال و اثربخش در حوزه حکمرانی نظام اسلامی و با اولویت مسائل حوزه خانواده، تعلیم و تربیت، رسانه و مدیریت از طریق طراحی، تدوین، پیاده سازی و نشر مدل‌های کاربردی فعالیت می‌نماید. در حال حاضر، سه اندیشکده و مرکز رصد ذیل پژوهشکده مهرستان مشغول به فعالیت هستند: